A operação deverá durar 10 dias e as autoridades esperam que decorra sem problemas.
Os primeiros 200 refugiados foram para um outro campo no norte da Grécia.
No total, mais de 400 pessoas deixaram Idomeni.
O Governo grego garante que os deslocados vão para campos com melhores condições.
Pela Grécia já passaram cerca de um milhão de refugiados, vindo sobretudo da Turquia.