Envolvido na chamada "Igreja de resistência", procurava uma mudança no comunismo checo e viveu intensamente a Primavera de Praga no final dos anos 60 com a invasão da então Checoslováquia pelas tropas e aviação da União Soviética. Conhecia Jan Palach, o estudante que se imolou pelo fogo em protesto contra o regime comunista.
Depois de ser ordenado sacerdote católico na Alemanha de Leste, em 1978, foi terapeuta na recuperação de toxicodependentes. Depois da Revolução de Veludo em 1989, que mudou o regime e a configuração do país natal, Halík foi conselheiro do presidente Vaclac Havel. Este ainda sugeriu que o amigo padre lhe sucedesse no cargo.
Laureado com o Prémio Templeton em 2014, Tomáš Halík é autor de várias obras lidas em todo o mundo, tidas como referências do pensamento cristão, moderno e humanista. É um admirador da dinâmica espiritual dos jesuitas, também sente dúvidas quanto ao celibato e outras imposições doutrinárias.
A experiência de vida abriu-lhe os horizontes da palavra ousada e da crítica assertiva, nomeadamente às incoerências da Igreja. A propósito do mais recente livro - Diante de Ti os Meus Caminhos - Halík esteve em novembro em Lisboa.
Foi entrevistado pela SIC e pelo blogue Religionline, abordando o seu trajeto cívico, político e religioso, mas sobretudo relendo o presente da Europa, do Mundo e da Igreja com um olhar pragmático e realista.