Um "projétil não identificado" foi disparado de Pyongyang na madrugada de terça-feira, cerca das 05:57 locais (21:57 de segunda-feira, em Lisboa), segundo o Estado-Maior das Forças Armadas da Coreia do Sul.
Um porta-voz do Ministério da Defesa dos Estados Unidos também confirmou em comunicado o lançamento, sublinhando que não representa ameaça para a América do Norte.
"Determinámos que a Coreia do Norte fez um disparo de míssil nos últimos 90 minutos. Podemos confirmar que o míssil lançado pela Coreia do Norte sobrevoou o Japão", indicou o coronel Rob Manning, precisando que estão em curso mais análises em relação ao lançamento.
Nas redes sociais, foram publicados vídeos que mostram o momento em que a população é avisada do lançamento do míssil e aconselhada a procurar abrigo:
O primeiro-ministro japonês, Shinzo Abe, pediu uma reunião urgente do Conselho de Segurança da ONU e afirmou, em declarações à imprensa, que este disparo "inaceitável" representa "uma ameaça grave e sem precedentes que prejudica consideravelmente a paz e a segurança na região".
O Japão vai tomar "todas as medidas" necessárias para assegurar a segurança da população, declarou o primeiro-ministro.
Segundo um porta-voz do primeiro-ministro japonês, o míssil sobrevoou a ilha de Hokkaido, no norte do país, e caiu em águas do Pacífico a 1.180 quilómetros da costa japonesa.
"Não foi causado qualquer dano a aviões ou navios" na zona, acrescentou.
No sábado, a Coreia do Norte disparou três mísseis de curto alcance no mar do Japão, quando milhares de soldados norte-americanos e sul-coreanos participavam em manobras na península.
Estes lançamentos ocorrem num contexto de tensão exacerbada entre Washington e Pyongyang.
Este é apenas o segundo lançamento de um míssil feito pela Coreia do Norte, a sobrevoar o Japão. O primeiro aconteceu em 1998.